薩摩や長州くらいの巨大勢力になると色んな派閥に分かれるから人斬り部門も藩の意向とは違うんだよね
例えば薩摩は同じ藩内で派閥対立していたり、長州も同門の久坂と高杉は別々の活動をしてたりする

いずれの場合も藩主が寛大にこれを見守っている点が共通している