単純に朝敵として討伐されるのは嫌だったから大阪城から敵前逃亡したんだろうな。

慶喜の手としてはフランス軍と結託して天皇殲滅薩長殲滅　徳川による独裁国家を作るという手もあったかと。
勝ったほうが正義ですから。